Для оценки вероятности конечных событий через FTA необходимо следовать следующему алгоритму: собрать статистику по частоте возникновения базовых событий (на листьях дерева) – это могут быть данные об отказах оборудования, ошибок программного обеспечения или действий персонала; определить для каждого логического оператора формулу расчета вероятности: для оператора «И» вероятность события равна произведению вероятностей входящих событий, для оператора «ИЛИ» (при независимых событиях) – 1 минус произведение дополнений вероятностей; последовательно рассчитать вероятности по всем уровням дерева, начиная с базовых событий и поднимаясь к топ-событию. В случае сложных деревьев могут применяться программные инструменты для автоматизации расчетов. Полученная вероятность топ-события дает количественную оценку риска, которая может быть использована для сравнения с допустимыми уровнями риска и принятия решений об улучшении системы.