Когда владельцем сквозного процесса назначают руководителя одного из подразделений, участвующих в процессе, часто возникает проблема недостатка полномочий для управления всем процессом. Например, если владельцем процесса управления инцидентами назначают руководителя первой линии поддержки, он не сможет обеспечить необходимую работу последующих линий поддержки, так как у него нет власти над теми подразделениями. Это приводит к тому, что процесс работает не так, как был спроектирован, и возникают постоянные конфликты между подразделениями. Проблема особенно остра в организациях, где только начинают внедрять процессный подход и сталкиваются с противодействием и непониманием новых порядков. В зрелых процессно-ориентированных организациях эта проблема менее выражена, так как работают другие механизмы координации и управления, но при формировании сквозных процессов важно, чтобы владелец имел достаточные полномочия, охватывающие все подразделения, участвующие в процессе.