При попытке применить Agile «в лоб» к эксплуатации ИТ возникают проблемы, связанные со спецификой эксплуатации. Эксплуатация требует обеспечения стабильности, доступности и непрерывности сервисов, что не всегда совместимо с частыми изменениями, характерными для итеративного подхода. Движение итерациями в эксплуатации может приводить к нестабильности, если не учитывать требования к надёжности и безопасности. Кроме того, работа команды разработки, сводящаяся к постоянному бегу по кругу (спринтам), не учитывает, что разработанный продукт эксплуатируется другим подразделением, работающим по иным правилам.