В операционный аудит CMDB входит обработка сверок, то есть проверка соответствия данных в CMDB фактическому состоянию конфигурационных единиц в оперативном режиме, обычно в ходе выполнения других операций с конфигурационными единицами. Периодический аудит CMDB подразумевает выборочную или полную проверку данных с определенной периодичностью для обеспечения их точности и полноты. Оба вида аудита являются важными компонентами процесса сопровождения CMDB, направленными на поддержание данных в актуальном и достоверном состоянии. Эти задачи требуют определенных трудозатрат, которые необходимо учитывать при планировании ресурсов на сопровождение CMDB, особенно при широком охвате учета конфигурационных единиц.