Основные недостатки: (1) Высокая совокупная стоимость владения — цена поддержки, доработок и исправления ошибок кратно превышает стоимость лицензий и обновлений коробки, причём расходы растут нелинейно со временем. (2) Невозможность использовать инновации вендора — принципиальное обновление системы становится технически сложным или требует полной пересборки. (3) Зависимость от ключевых людей — знание о системе находится в головах конкретных разработчиков, их уход парализует развитие. (4) Технический долг — каждая нестандартная доработка становится кирпичиком в стене будущих проблем, добавление функциональности превращается в многонедельное копание в чужом коде. (5) Высокие риски проекта — долгострой, срыв сроков, архитектурные ошибки, слабое документирование.