Организационная структура может существенно повлиять на успех внедрения ИТ-процессов, так как различные типы структур имеют свои особенности в коммуникации, принятии решений и распределении ответственности. Например, в иерархических структурах процессы утверждения решений могут быть более длительными, что требует особого внимания к этапам согласования. В матричных структурах важно учитывать двойное подчинение сотрудников и соответствующим образом настраивать процессы. Некоторые процессы, успешно работающие в одной организационной структуре, могут быть неэффективны в другой. Поэтому при внедрении ИТ-процессов критически важно учитывать особенности организационной структуры, что требует как от консультантов, так и от заказчиков глубокого понимания этой структуры и её влияния на процессы.