Системный подход к управлению рисками в ИТ-организации предполагает комплексную идентификацию, анализ рисков и принятие решений о контрмерах на уровне всей организации, а не изолированно в отдельных процессах. Такой подход учитывает, что оценки одного и того же риска могут сильно разниться в зависимости от того, кто его оценивает и какой информацией обладает. Системный подход требует приведения оценок экспертов из разных областей к общему знаменателю и создания единого центра накопления и поддержания информации о рисках. В идеале должна быть создана централизованная функция, которая администрирует информацию о рисках, включая показатели вероятности и ущерба, и предоставляет ее всем заинтересованным сторонам для принятия управленческих решений, обеспечивая тем самым более целостное и эффективное управление.