Основные проблемы сетевых сканеров: они фиксируют всё установленное ПО, включая программы, не требующие лицензирования; названия продуктов в результатах сканирования часто не совпадают с официальными наименованиями (требуется ручное сопоставление); сканеры не определяют тип лицензии и её коэффициенты (например, лицензия на два процессора при наличии восьмиядерного сервера). Это вынуждает операторов вручную классифицировать данные и корректировать отчёты, чтобы система могла правильно рассчитать объём необходимых лицензий.