Основные ограничения гибких методологий в контексте эксплуатации ИТ связаны с их фокусом на разработке и временных целях, а не на долгосрочной поддержке. Гибкие методологии, такие как Agile, не обеспечивают четкой структуры для постоянного обслуживания систем после завершения проекта. Отсутствует механизм управления повторяющимися стандартными задачами, которые не требуют итеративного развития. Кроме того, гибкие подходы часто не учитывают потребности в документировании и стандартизированных процессах, необходимых для эффективной эксплуатации.