При использовании causal loop diagram (CLD) в реальных ИТ-организациях возникают несколько практических сложностей. Во-первых, с расширением диаграммы (увеличением количества переменных) она становится практически нечитаемой, поэтому важно сохранять фокус на конкретной проблеме и не включать все возможные факторы. Трудность заключается в том, что в процессе анализа постоянно открываются новые факторы, и сложно определить, какие из них критичны для анализа, а какие можно пренебречь. Во-вторых, связи между переменными в реальной жизни могут быть не такими однозначными, как на диаграмме - например, большой Backlog Size не всегда приводит к увеличению Release Size, что зависит от конкретного случая и культуры организации. В-третьих, построение CLD требует глубокого понимания всех процессов и взаимодействий в организации, что часто недоступно одному человеку и требует командной работы. В-четвертых, даже при согласованной диаграмме сложно определить, какие именно точки воздействия будут эффективны для изменения всей системы. Тем не менее, несмотря на эти сложности, CLD остается ценным инструментом для визуализации и объяснения сложных системных явлений в ИТ-организациях.