Основные проблемы при внедрении практики управления проблемами в организации включают: путаницу в терминах (непонимание разницы между проблемой и инцидентом); недостаточное понимание бизнес-ценности этой деятельности особенно на начальном этапе; конфликт интересов между оперативной работой по управлению инцидентами и аналитической работой по управлению проблемами; необходимость в более высоком уровне компетенции сотрудников для анализа первопричин; отсутствие количественных показателей для демонстрации эффективности; нежелание бизнеса инвестировать в 'невидимую' деятельность, которая приносит результаты в долгосрочной перспективе.