Назначение начальника отдела поддержки пользователей (Service Desk) менеджером процесса управления инцидентами приводит к вытеснению функций менеджера сквозного процесса функциями руководителя отдела поддержки. Это создает ряд проблем: сложности во взаимодействии со второй линией поддержки, появление изолированных видов поддержки, когда обращения поступают мимо первой линии без регистрации в системе автоматизации. Особенно эта проблема актуальна в отделах сопровождения прикладных систем, так как первая линия часто недостаточно компетентна для оказания полноценной поддержки по прикладному ПО. В результате пользователи и специалисты воспринимают первую линию как лишнее звено, увеличивающее время обработки обращений, а ценность процесса управления инцидентами снижается, так как основные риски связаны с нарушениями в работе прикладного ПО.